Ильменский государственный заповедник им. В.И. Ленина Челябинского научного центра УрО РАН, старейшее научно-исследовательское учреждение в составе Уральского отделения РАН, один из первых заповедников в России.
История исследования Ильмен началась более 200 лет назад, когда стало известно в России и Европе о богатстве и своеобразии Ильменских гор.
В разные годы здесь побывали известные немецкие ученые-минералоги и коллекционеры: И. Менге, А. Гумбольдт, Г. Розе, работали академики Н. И. Кокшаров, П. В Еремеев, А. П. Карпинский, Д. С. Белянкин, В. И. Вернадский, А. Н. Заварицкий, А. Е. Ферсман и многие другие.В 1920 году Ильменские горы были объявлены минералогическим заповедником, одним из первых заповедников, созданных в России. Сегодня это природоохранное, научно-исследовательское государственное учреждение со статусом института в составе Уральского отделения Российской Академии наук. Целью деятельности заповедника является сохранение в естественном состоянии природного комплекса, выполнение фундаментальных научных исследований геолого-минералогического, эколого-биологического профиля, экологическое и естественно-научное просвещение населения.
Является эталонным участком биосферы, представляющим уникальный ландшафтный комплекс восточного макросклона Уральского хр. Площадь Ильменского заповедника составляет 303.8 кв. км, из которых около 9 % приходится на акватории, представленные многочисленными озерами. На территории заповедника.заложено около 400 копей, где установлено свыше 70 горных пород, 268 видов и 94 разновидностей минералов, из которых 16 впервые открыты в Ильменах. Растительный покров представлен преимущественно различными типами сосново-березовых лесов, занимающих 85 % территории. В своеобразной по составу и генезису флоре сосудистых растений представлены: высших растений – 823 (50 реликтов, 23 эндемика), низших растений – более 270 видов. Фауна позвоночных насчитывает 221 вид, видовой состав беспозвоночных животных оценивается более чем в 10 тыс. видов.
Коллектив заповедника проводит геологические исследования, направленные на разработку и построение модели формирования Ильменогорскогополиметаморфической зоны в интервале архей–верхний палеозой. Длительность формирования изучаемого комплекса (2300–160 млн лет), полицикличность и разнонаправленность процессов, в нем проявленных, сформировали исключительной разнообразие слагающих его пород – магматических, метаморфических, метасоматических, пегматитов. За более, чем 200-летнюю историю изучения Ильменогорского комплекса, он являлся основой для разработки многих фундаментальных проблем в области минералогии, магмообразования, метаморфизма и т. д. В настоящее время минералогами заповедника ведутся исследования гетерогенности составов породообразующих минералов – гранатов, амфиболов, пироксенов, слюды и т. д. в петрогенетических типах магматических и метаморфических пород с целью определения направленности и термодинамических параметров геологических процессов.
На территории заповедника находится 16 крупных и более 14 мелких озер и озеровидных водоемов. Разные по возрасту, морфологии, продуктивности и другим параметрам, почти не нарушенные антропогенным воздействием, расположенные на небольшой тер.в общих ландшафтно-климатических условиях, они представляют собой уникальный полигон для комплексных гидроэкологических исследований. Являясь одной из основных составляющих заповедника, водные объекты полно и динамично отражают его экологическое состояние и эффективность природоохранных мероприятий.
Одним из основных направлений деятельности Ильменского государственного заповедника является оценка состояния и проблемы сохранения биоразнообразия. Более 60 лет ведутся работы по программе «Летопись природы».